Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLD6

Ankrd55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd55Q8BLD6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd55Q8BLD6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd55Q8BLD6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms