Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL74

Gtf3c2, General transcription factor 3C polypeptide 2, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c2Q8BL74 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf3c2Q8BL74 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf3c2Q8BL74 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf3c2Q8BL74 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf3c2Q8BL74 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf3c2Q8BL74 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf3c2Q8BL74 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf3c2Q8BL74 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf3c2Q8BL74 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf3c2Q8BL74 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf3c2Q8BL74 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf3c2Q8BL74 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtf3c2Q8BL74 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf3c2Q8BL74 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf3c2Q8BL74 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf3c2Q8BL74 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf3c2Q8BL74 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf3c2Q8BL74 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf3c2Q8BL74 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf3c2Q8BL74 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf3c2Q8BL74 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf3c2Q8BL74 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf3c2Q8BL74 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf3c2Q8BL74 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtf3c2Q8BL74 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf3c2Q8BL74 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf3c2Q8BL74 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf3c2Q8BL74 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf3c2Q8BL74 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf3c2Q8BL74 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtf3c2Q8BL74 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf3c2Q8BL74 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms