Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tspan12Q8BKT6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms