Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gabra5Q8BHJ7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gabra5Q8BHJ7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gabra5Q8BHJ7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gabra5Q8BHJ7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gabra5Q8BHJ7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gabra5Q8BHJ7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gabra5Q8BHJ7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gabra5Q8BHJ7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gabra5Q8BHJ7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gabra5Q8BHJ7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gabra5Q8BHJ7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms