Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ2

Csrnp2, Cysteine/serine-rich nuclear protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp2Q8BGQ2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csrnp2Q8BGQ2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csrnp2Q8BGQ2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csrnp2Q8BGQ2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csrnp2Q8BGQ2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csrnp2Q8BGQ2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csrnp2Q8BGQ2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csrnp2Q8BGQ2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csrnp2Q8BGQ2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csrnp2Q8BGQ2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csrnp2Q8BGQ2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csrnp2Q8BGQ2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csrnp2Q8BGQ2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csrnp2Q8BGQ2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Csrnp2Q8BGQ2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csrnp2Q8BGQ2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csrnp2Q8BGQ2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csrnp2Q8BGQ2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csrnp2Q8BGQ2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Csrnp2Q8BGQ2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csrnp2Q8BGQ2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csrnp2Q8BGQ2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csrnp2Q8BGQ2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csrnp2Q8BGQ2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csrnp2Q8BGQ2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csrnp2Q8BGQ2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csrnp2Q8BGQ2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csrnp2Q8BGQ2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csrnp2Q8BGQ2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csrnp2Q8BGQ2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csrnp2Q8BGQ2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csrnp2Q8BGQ2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csrnp2Q8BGQ2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csrnp2Q8BGQ2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csrnp2Q8BGQ2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csrnp2Q8BGQ2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csrnp2Q8BGQ2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csrnp2Q8BGQ2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csrnp2Q8BGQ2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csrnp2Q8BGQ2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Csrnp2Q8BGQ2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csrnp2Q8BGQ2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csrnp2Q8BGQ2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csrnp2Q8BGQ2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csrnp2Q8BGQ2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csrnp2Q8BGQ2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csrnp2Q8BGQ2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csrnp2Q8BGQ2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Csrnp2Q8BGQ2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csrnp2Q8BGQ2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csrnp2Q8BGQ2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csrnp2Q8BGQ2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Csrnp2Q8BGQ2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csrnp2Q8BGQ2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csrnp2Q8BGQ2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csrnp2Q8BGQ2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csrnp2Q8BGQ2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Csrnp2Q8BGQ2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csrnp2Q8BGQ2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csrnp2Q8BGQ2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csrnp2Q8BGQ2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csrnp2Q8BGQ2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csrnp2Q8BGQ2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csrnp2Q8BGQ2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csrnp2Q8BGQ2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csrnp2Q8BGQ2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Csrnp2Q8BGQ2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Csrnp2Q8BGQ2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Csrnp2Q8BGQ2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Csrnp2Q8BGQ2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csrnp2Q8BGQ2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csrnp2Q8BGQ2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csrnp2Q8BGQ2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Csrnp2Q8BGQ2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csrnp2Q8BGQ2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csrnp2Q8BGQ2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csrnp2Q8BGQ2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csrnp2Q8BGQ2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csrnp2Q8BGQ2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csrnp2Q8BGQ2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csrnp2Q8BGQ2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csrnp2Q8BGQ2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Csrnp2Q8BGQ2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csrnp2Q8BGQ2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csrnp2Q8BGQ2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csrnp2Q8BGQ2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csrnp2Q8BGQ2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csrnp2Q8BGQ2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csrnp2Q8BGQ2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csrnp2Q8BGQ2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csrnp2Q8BGQ2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csrnp2Q8BGQ2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csrnp2Q8BGQ2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csrnp2Q8BGQ2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csrnp2Q8BGQ2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csrnp2Q8BGQ2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csrnp2Q8BGQ2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csrnp2Q8BGQ2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csrnp2Q8BGQ2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csrnp2Q8BGQ2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms