Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg4bQ8BGE6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg4bQ8BGE6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg4bQ8BGE6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg4bQ8BGE6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg4bQ8BGE6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg4bQ8BGE6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg4bQ8BGE6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg4bQ8BGE6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg4bQ8BGE6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg4bQ8BGE6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg4bQ8BGE6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg4bQ8BGE6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg4bQ8BGE6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg4bQ8BGE6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg4bQ8BGE6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg4bQ8BGE6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg4bQ8BGE6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg4bQ8BGE6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg4bQ8BGE6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg4bQ8BGE6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg4bQ8BGE6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg4bQ8BGE6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg4bQ8BGE6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg4bQ8BGE6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg4bQ8BGE6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg4bQ8BGE6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg4bQ8BGE6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg4bQ8BGE6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg4bQ8BGE6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg4bQ8BGE6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg4bQ8BGE6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg4bQ8BGE6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg4bQ8BGE6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms