Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Htatsf1Q8BGC0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Htatsf1Q8BGC0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Htatsf1Q8BGC0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Htatsf1Q8BGC0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Htatsf1Q8BGC0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Htatsf1Q8BGC0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Htatsf1Q8BGC0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Htatsf1Q8BGC0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Htatsf1Q8BGC0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Htatsf1Q8BGC0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Htatsf1Q8BGC0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Htatsf1Q8BGC0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Htatsf1Q8BGC0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Htatsf1Q8BGC0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Htatsf1Q8BGC0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Htatsf1Q8BGC0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Htatsf1Q8BGC0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Htatsf1Q8BGC0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Htatsf1Q8BGC0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Htatsf1Q8BGC0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Htatsf1Q8BGC0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Htatsf1Q8BGC0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Htatsf1Q8BGC0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Htatsf1Q8BGC0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Htatsf1Q8BGC0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Htatsf1Q8BGC0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Htatsf1Q8BGC0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Htatsf1Q8BGC0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Htatsf1Q8BGC0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Htatsf1Q8BGC0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Htatsf1Q8BGC0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Htatsf1Q8BGC0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Htatsf1Q8BGC0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Htatsf1Q8BGC0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Htatsf1Q8BGC0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Htatsf1Q8BGC0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Htatsf1Q8BGC0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Htatsf1Q8BGC0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Htatsf1Q8BGC0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Htatsf1Q8BGC0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Htatsf1Q8BGC0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Htatsf1Q8BGC0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Htatsf1Q8BGC0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Htatsf1Q8BGC0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Htatsf1Q8BGC0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Htatsf1Q8BGC0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Htatsf1Q8BGC0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Htatsf1Q8BGC0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Htatsf1Q8BGC0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Htatsf1Q8BGC0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Htatsf1Q8BGC0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Htatsf1Q8BGC0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Htatsf1Q8BGC0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Htatsf1Q8BGC0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Htatsf1Q8BGC0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Htatsf1Q8BGC0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Htatsf1Q8BGC0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Htatsf1Q8BGC0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Htatsf1Q8BGC0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Htatsf1Q8BGC0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Htatsf1Q8BGC0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Htatsf1Q8BGC0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Htatsf1Q8BGC0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Htatsf1Q8BGC0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Htatsf1Q8BGC0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Htatsf1Q8BGC0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Htatsf1Q8BGC0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Htatsf1Q8BGC0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Htatsf1Q8BGC0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Htatsf1Q8BGC0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Htatsf1Q8BGC0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Htatsf1Q8BGC0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Htatsf1Q8BGC0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Htatsf1Q8BGC0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Htatsf1Q8BGC0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Htatsf1Q8BGC0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Htatsf1Q8BGC0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Htatsf1Q8BGC0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Htatsf1Q8BGC0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Htatsf1Q8BGC0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Htatsf1Q8BGC0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Htatsf1Q8BGC0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Htatsf1Q8BGC0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Htatsf1Q8BGC0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Htatsf1Q8BGC0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Htatsf1Q8BGC0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Htatsf1Q8BGC0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Htatsf1Q8BGC0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Htatsf1Q8BGC0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Htatsf1Q8BGC0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Htatsf1Q8BGC0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Htatsf1Q8BGC0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Htatsf1Q8BGC0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Htatsf1Q8BGC0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Htatsf1Q8BGC0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Htatsf1Q8BGC0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Htatsf1Q8BGC0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Htatsf1Q8BGC0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Htatsf1Q8BGC0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms