Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrtm2Q8BGA3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms