Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG55

Gpr171, Probable G-protein coupled receptor 171, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr171Q8BG55 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpr171Q8BG55 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpr171Q8BG55 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpr171Q8BG55 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gpr171Q8BG55 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpr171Q8BG55 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpr171Q8BG55 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpr171Q8BG55 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpr171Q8BG55 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpr171Q8BG55 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpr171Q8BG55 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpr171Q8BG55 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpr171Q8BG55 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpr171Q8BG55 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpr171Q8BG55 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpr171Q8BG55 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpr171Q8BG55 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpr171Q8BG55 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpr171Q8BG55 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpr171Q8BG55 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpr171Q8BG55 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpr171Q8BG55 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpr171Q8BG55 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpr171Q8BG55 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpr171Q8BG55 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpr171Q8BG55 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpr171Q8BG55 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpr171Q8BG55 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpr171Q8BG55 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpr171Q8BG55 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpr171Q8BG55 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpr171Q8BG55 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpr171Q8BG55 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpr171Q8BG55 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms