Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG54

Sptlc3, Serine palmitoyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptlc3Q8BG54 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sptlc3Q8BG54 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sptlc3Q8BG54 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sptlc3Q8BG54 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sptlc3Q8BG54 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sptlc3Q8BG54 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sptlc3Q8BG54 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sptlc3Q8BG54 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sptlc3Q8BG54 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sptlc3Q8BG54 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sptlc3Q8BG54 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sptlc3Q8BG54 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sptlc3Q8BG54 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sptlc3Q8BG54 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sptlc3Q8BG54 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sptlc3Q8BG54 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sptlc3Q8BG54 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sptlc3Q8BG54 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Sptlc3Q8BG54 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sptlc3Q8BG54 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sptlc3Q8BG54 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sptlc3Q8BG54 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sptlc3Q8BG54 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sptlc3Q8BG54 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sptlc3Q8BG54 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sptlc3Q8BG54 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Sptlc3Q8BG54 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sptlc3Q8BG54 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sptlc3Q8BG54 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sptlc3Q8BG54 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sptlc3Q8BG54 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sptlc3Q8BG54 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sptlc3Q8BG54 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sptlc3Q8BG54 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sptlc3Q8BG54 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sptlc3Q8BG54 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sptlc3Q8BG54 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sptlc3Q8BG54 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sptlc3Q8BG54 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sptlc3Q8BG54 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sptlc3Q8BG54 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sptlc3Q8BG54 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sptlc3Q8BG54 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sptlc3Q8BG54 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sptlc3Q8BG54 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sptlc3Q8BG54 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sptlc3Q8BG54 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sptlc3Q8BG54 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sptlc3Q8BG54 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sptlc3Q8BG54 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sptlc3Q8BG54 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sptlc3Q8BG54 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sptlc3Q8BG54 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sptlc3Q8BG54 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sptlc3Q8BG54 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sptlc3Q8BG54 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sptlc3Q8BG54 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sptlc3Q8BG54 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sptlc3Q8BG54 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sptlc3Q8BG54 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sptlc3Q8BG54 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sptlc3Q8BG54 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sptlc3Q8BG54 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sptlc3Q8BG54 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sptlc3Q8BG54 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sptlc3Q8BG54 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sptlc3Q8BG54 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sptlc3Q8BG54 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sptlc3Q8BG54 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sptlc3Q8BG54 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sptlc3Q8BG54 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sptlc3Q8BG54 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sptlc3Q8BG54 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sptlc3Q8BG54 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sptlc3Q8BG54 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sptlc3Q8BG54 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sptlc3Q8BG54 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sptlc3Q8BG54 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sptlc3Q8BG54 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sptlc3Q8BG54 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sptlc3Q8BG54 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sptlc3Q8BG54 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sptlc3Q8BG54 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sptlc3Q8BG54 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sptlc3Q8BG54 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Sptlc3Q8BG54 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sptlc3Q8BG54 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Sptlc3Q8BG54 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sptlc3Q8BG54 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sptlc3Q8BG54 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sptlc3Q8BG54 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sptlc3Q8BG54 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sptlc3Q8BG54 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sptlc3Q8BG54 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sptlc3Q8BG54 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sptlc3Q8BG54 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sptlc3Q8BG54 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sptlc3Q8BG54 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sptlc3Q8BG54 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sptlc3Q8BG54 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms