Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG15

Ctdspl2, CTD small phosphatase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdspl2Q8BG15 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctdspl2Q8BG15 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctdspl2Q8BG15 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctdspl2Q8BG15 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctdspl2Q8BG15 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctdspl2Q8BG15 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ctdspl2Q8BG15 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctdspl2Q8BG15 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctdspl2Q8BG15 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctdspl2Q8BG15 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctdspl2Q8BG15 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctdspl2Q8BG15 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctdspl2Q8BG15 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctdspl2Q8BG15 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctdspl2Q8BG15 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctdspl2Q8BG15 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctdspl2Q8BG15 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctdspl2Q8BG15 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctdspl2Q8BG15 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctdspl2Q8BG15 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctdspl2Q8BG15 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctdspl2Q8BG15 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctdspl2Q8BG15 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctdspl2Q8BG15 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctdspl2Q8BG15 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctdspl2Q8BG15 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctdspl2Q8BG15 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctdspl2Q8BG15 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctdspl2Q8BG15 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctdspl2Q8BG15 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctdspl2Q8BG15 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctdspl2Q8BG15 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctdspl2Q8BG15 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctdspl2Q8BG15 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms