Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc50Q810U5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc50Q810U5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc50Q810U5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc50Q810U5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc50Q810U5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc50Q810U5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc50Q810U5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc50Q810U5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc50Q810U5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc50Q810U5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc50Q810U5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc50Q810U5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc50Q810U5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc50Q810U5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc50Q810U5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc50Q810U5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc50Q810U5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc50Q810U5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc50Q810U5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc50Q810U5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc50Q810U5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc50Q810U5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc50Q810U5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc50Q810U5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc50Q810U5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc50Q810U5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc50Q810U5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc50Q810U5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc50Q810U5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc50Q810U5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc50Q810U5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc50Q810U5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc50Q810U5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc50Q810U5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc50Q810U5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc50Q810U5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc50Q810U5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc50Q810U5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc50Q810U5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc50Q810U5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc50Q810U5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc50Q810U5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc50Q810U5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc50Q810U5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc50Q810U5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc50Q810U5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc50Q810U5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc50Q810U5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms