Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ell3Q80VR2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms