Protein–RNA interactions for Protein: Q80U62

Rubcn, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnQ80U62 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RubcnQ80U62 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RubcnQ80U62 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RubcnQ80U62 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RubcnQ80U62 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RubcnQ80U62 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RubcnQ80U62 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RubcnQ80U62 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RubcnQ80U62 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RubcnQ80U62 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RubcnQ80U62 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RubcnQ80U62 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RubcnQ80U62 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RubcnQ80U62 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RubcnQ80U62 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RubcnQ80U62 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RubcnQ80U62 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RubcnQ80U62 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RubcnQ80U62 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RubcnQ80U62 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RubcnQ80U62 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RubcnQ80U62 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RubcnQ80U62 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RubcnQ80U62 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RubcnQ80U62 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RubcnQ80U62 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RubcnQ80U62 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RubcnQ80U62 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RubcnQ80U62 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RubcnQ80U62 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RubcnQ80U62 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RubcnQ80U62 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RubcnQ80U62 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RubcnQ80U62 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RubcnQ80U62 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RubcnQ80U62 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RubcnQ80U62 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RubcnQ80U62 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RubcnQ80U62 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RubcnQ80U62 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RubcnQ80U62 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RubcnQ80U62 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RubcnQ80U62 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RubcnQ80U62 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RubcnQ80U62 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RubcnQ80U62 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RubcnQ80U62 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RubcnQ80U62 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RubcnQ80U62 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RubcnQ80U62 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RubcnQ80U62 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RubcnQ80U62 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RubcnQ80U62 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RubcnQ80U62 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RubcnQ80U62 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RubcnQ80U62 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RubcnQ80U62 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RubcnQ80U62 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RubcnQ80U62 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RubcnQ80U62 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RubcnQ80U62 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RubcnQ80U62 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RubcnQ80U62 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RubcnQ80U62 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RubcnQ80U62 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RubcnQ80U62 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RubcnQ80U62 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RubcnQ80U62 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RubcnQ80U62 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RubcnQ80U62 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RubcnQ80U62 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RubcnQ80U62 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RubcnQ80U62 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RubcnQ80U62 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RubcnQ80U62 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RubcnQ80U62 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RubcnQ80U62 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RubcnQ80U62 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RubcnQ80U62 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RubcnQ80U62 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RubcnQ80U62 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RubcnQ80U62 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RubcnQ80U62 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RubcnQ80U62 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RubcnQ80U62 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RubcnQ80U62 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RubcnQ80U62 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RubcnQ80U62 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RubcnQ80U62 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RubcnQ80U62 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RubcnQ80U62 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RubcnQ80U62 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RubcnQ80U62 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RubcnQ80U62 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RubcnQ80U62 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RubcnQ80U62 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RubcnQ80U62 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RubcnQ80U62 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RubcnQ80U62 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RubcnQ80U62 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms