Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
NischQ80TM9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
NischQ80TM9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
NischQ80TM9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC41.63■■■■■ 4.25
NischQ80TM9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
NischQ80TM9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
NischQ80TM9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC41.62■■■■■ 4.25
NischQ80TM9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC41.62■■■■■ 4.25
NischQ80TM9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
NischQ80TM9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC41.62■■■■■ 4.25
NischQ80TM9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
NischQ80TM9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
NischQ80TM9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
NischQ80TM9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
NischQ80TM9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC41.61■■■■■ 4.25
NischQ80TM9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC41.61■■■■■ 4.25
NischQ80TM9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
NischQ80TM9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
NischQ80TM9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
NischQ80TM9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
NischQ80TM9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC41.6■■■■■ 4.25
NischQ80TM9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
NischQ80TM9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
NischQ80TM9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
NischQ80TM9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
NischQ80TM9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
NischQ80TM9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
NischQ80TM9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
NischQ80TM9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
NischQ80TM9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
NischQ80TM9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
NischQ80TM9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC41.58■■■■■ 4.25
NischQ80TM9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
NischQ80TM9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC41.58■■■■■ 4.25
NischQ80TM9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC41.57■■■■■ 4.25
NischQ80TM9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC41.57■■■■■ 4.24
NischQ80TM9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.24
NischQ80TM9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC41.56■■■■■ 4.24
NischQ80TM9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
NischQ80TM9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
NischQ80TM9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
NischQ80TM9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC41.56■■■■■ 4.24
NischQ80TM9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
NischQ80TM9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
NischQ80TM9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
NischQ80TM9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
NischQ80TM9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC41.55■■■■■ 4.24
NischQ80TM9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
NischQ80TM9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC41.54■■■■■ 4.24
NischQ80TM9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
NischQ80TM9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
NischQ80TM9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
NischQ80TM9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
NischQ80TM9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
NischQ80TM9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
NischQ80TM9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.53■■■■■ 4.24
NischQ80TM9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
NischQ80TM9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
NischQ80TM9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
NischQ80TM9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC41.52■■■■■ 4.24
NischQ80TM9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
NischQ80TM9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC41.51■■■■■ 4.24
NischQ80TM9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
NischQ80TM9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
NischQ80TM9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
NischQ80TM9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
NischQ80TM9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
NischQ80TM9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
NischQ80TM9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
NischQ80TM9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC41.5■■■■■ 4.23
NischQ80TM9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
NischQ80TM9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
NischQ80TM9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC41.49■■■■■ 4.23
NischQ80TM9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC41.49■■■■■ 4.23
NischQ80TM9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
NischQ80TM9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
NischQ80TM9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
NischQ80TM9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
NischQ80TM9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC41.48■■■■■ 4.23
NischQ80TM9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
NischQ80TM9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC41.48■■■■■ 4.23
NischQ80TM9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
NischQ80TM9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
NischQ80TM9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC41.47■■■■■ 4.23
NischQ80TM9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC41.46■■■■■ 4.23
NischQ80TM9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC41.46■■■■■ 4.23
NischQ80TM9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
NischQ80TM9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
NischQ80TM9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
NischQ80TM9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
NischQ80TM9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
NischQ80TM9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
NischQ80TM9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
NischQ80TM9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
NischQ80TM9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
NischQ80TM9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC41.43■■■■■ 4.22
NischQ80TM9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC41.43■■■■■ 4.22
NischQ80TM9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC41.43■■■■■ 4.22
NischQ80TM9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC41.43■■■■■ 4.22
NischQ80TM9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.43■■■■■ 4.22
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