Protein–RNA interactions for Protein: Q80ST9

Lca5, Lebercilin, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lca5Q80ST9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lca5Q80ST9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lca5Q80ST9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lca5Q80ST9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lca5Q80ST9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lca5Q80ST9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lca5Q80ST9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lca5Q80ST9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lca5Q80ST9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lca5Q80ST9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lca5Q80ST9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lca5Q80ST9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lca5Q80ST9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lca5Q80ST9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lca5Q80ST9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lca5Q80ST9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lca5Q80ST9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lca5Q80ST9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lca5Q80ST9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lca5Q80ST9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lca5Q80ST9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lca5Q80ST9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lca5Q80ST9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lca5Q80ST9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lca5Q80ST9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lca5Q80ST9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lca5Q80ST9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms