Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cdc42bpbQ7TT50 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cdc42bpbQ7TT50 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cdc42bpbQ7TT50 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cdc42bpbQ7TT50 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Cdc42bpbQ7TT50 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cdc42bpbQ7TT50 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cdc42bpbQ7TT50 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cdc42bpbQ7TT50 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cdc42bpbQ7TT50 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cdc42bpbQ7TT50 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cdc42bpbQ7TT50 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Cdc42bpbQ7TT50 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cdc42bpbQ7TT50 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cdc42bpbQ7TT50 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cdc42bpbQ7TT50 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cdc42bpbQ7TT50 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cdc42bpbQ7TT50 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cdc42bpbQ7TT50 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cdc42bpbQ7TT50 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cdc42bpbQ7TT50 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cdc42bpbQ7TT50 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cdc42bpbQ7TT50 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cdc42bpbQ7TT50 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cdc42bpbQ7TT50 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Cdc42bpbQ7TT50 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cdc42bpbQ7TT50 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cdc42bpbQ7TT50 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cdc42bpbQ7TT50 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cdc42bpbQ7TT50 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cdc42bpbQ7TT50 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cdc42bpbQ7TT50 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cdc42bpbQ7TT50 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cdc42bpbQ7TT50 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
Cdc42bpbQ7TT50 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cdc42bpbQ7TT50 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cdc42bpbQ7TT50 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cdc42bpbQ7TT50 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cdc42bpbQ7TT50 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cdc42bpbQ7TT50 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cdc42bpbQ7TT50 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cdc42bpbQ7TT50 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cdc42bpbQ7TT50 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cdc42bpbQ7TT50 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cdc42bpbQ7TT50 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cdc42bpbQ7TT50 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cdc42bpbQ7TT50 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cdc42bpbQ7TT50 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cdc42bpbQ7TT50 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cdc42bpbQ7TT50 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cdc42bpbQ7TT50 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cdc42bpbQ7TT50 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cdc42bpbQ7TT50 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cdc42bpbQ7TT50 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cdc42bpbQ7TT50 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cdc42bpbQ7TT50 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cdc42bpbQ7TT50 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cdc42bpbQ7TT50 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cdc42bpbQ7TT50 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cdc42bpbQ7TT50 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cdc42bpbQ7TT50 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cdc42bpbQ7TT50 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cdc42bpbQ7TT50 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cdc42bpbQ7TT50 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cdc42bpbQ7TT50 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cdc42bpbQ7TT50 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cdc42bpbQ7TT50 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cdc42bpbQ7TT50 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cdc42bpbQ7TT50 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cdc42bpbQ7TT50 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cdc42bpbQ7TT50 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cdc42bpbQ7TT50 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cdc42bpbQ7TT50 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cdc42bpbQ7TT50 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cdc42bpbQ7TT50 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cdc42bpbQ7TT50 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cdc42bpbQ7TT50 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cdc42bpbQ7TT50 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Cdc42bpbQ7TT50 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cdc42bpbQ7TT50 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cdc42bpbQ7TT50 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cdc42bpbQ7TT50 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdc42bpbQ7TT50 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdc42bpbQ7TT50 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdc42bpbQ7TT50 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdc42bpbQ7TT50 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdc42bpbQ7TT50 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdc42bpbQ7TT50 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdc42bpbQ7TT50 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cdc42bpbQ7TT50 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cdc42bpbQ7TT50 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cdc42bpbQ7TT50 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Cdc42bpbQ7TT50 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Cdc42bpbQ7TT50 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Cdc42bpbQ7TT50 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cdc42bpbQ7TT50 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cdc42bpbQ7TT50 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cdc42bpbQ7TT50 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms