Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Dsg1bQ7TSF1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms