Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms