Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nek5Q7TSC3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nek5Q7TSC3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nek5Q7TSC3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nek5Q7TSC3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nek5Q7TSC3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nek5Q7TSC3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nek5Q7TSC3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nek5Q7TSC3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nek5Q7TSC3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nek5Q7TSC3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nek5Q7TSC3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nek5Q7TSC3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nek5Q7TSC3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nek5Q7TSC3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nek5Q7TSC3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nek5Q7TSC3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms