Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQK5

Ccdc93, Coiled-coil domain-containing protein 93, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc93Q7TQK5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc93Q7TQK5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc93Q7TQK5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc93Q7TQK5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc93Q7TQK5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc93Q7TQK5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc93Q7TQK5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc93Q7TQK5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc93Q7TQK5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc93Q7TQK5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc93Q7TQK5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc93Q7TQK5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc93Q7TQK5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc93Q7TQK5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc93Q7TQK5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc93Q7TQK5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc93Q7TQK5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc93Q7TQK5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc93Q7TQK5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc93Q7TQK5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc93Q7TQK5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc93Q7TQK5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc93Q7TQK5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc93Q7TQK5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc93Q7TQK5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc93Q7TQK5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc93Q7TQK5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc93Q7TQK5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc93Q7TQK5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc93Q7TQK5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc93Q7TQK5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc93Q7TQK5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc93Q7TQK5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc93Q7TQK5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc93Q7TQK5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc93Q7TQK5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc93Q7TQK5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc93Q7TQK5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc93Q7TQK5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc93Q7TQK5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc93Q7TQK5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc93Q7TQK5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc93Q7TQK5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc93Q7TQK5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc93Q7TQK5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc93Q7TQK5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc93Q7TQK5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc93Q7TQK5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc93Q7TQK5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc93Q7TQK5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc93Q7TQK5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc93Q7TQK5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms