Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMS5

Abcg2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg2Q7TMS5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcg2Q7TMS5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcg2Q7TMS5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcg2Q7TMS5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcg2Q7TMS5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcg2Q7TMS5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcg2Q7TMS5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcg2Q7TMS5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Abcg2Q7TMS5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Abcg2Q7TMS5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Abcg2Q7TMS5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Abcg2Q7TMS5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Abcg2Q7TMS5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcg2Q7TMS5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcg2Q7TMS5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcg2Q7TMS5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcg2Q7TMS5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcg2Q7TMS5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcg2Q7TMS5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcg2Q7TMS5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcg2Q7TMS5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcg2Q7TMS5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcg2Q7TMS5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcg2Q7TMS5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcg2Q7TMS5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcg2Q7TMS5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcg2Q7TMS5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcg2Q7TMS5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcg2Q7TMS5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcg2Q7TMS5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcg2Q7TMS5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcg2Q7TMS5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcg2Q7TMS5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcg2Q7TMS5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcg2Q7TMS5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcg2Q7TMS5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcg2Q7TMS5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcg2Q7TMS5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcg2Q7TMS5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcg2Q7TMS5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcg2Q7TMS5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms