Protein–RNA interactions for Protein: Q7M764

Usp17le, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein E, mousemouse

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17leQ7M764 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp17leQ7M764 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp17leQ7M764 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp17leQ7M764 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp17leQ7M764 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp17leQ7M764 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp17leQ7M764 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp17leQ7M764 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp17leQ7M764 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp17leQ7M764 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp17leQ7M764 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp17leQ7M764 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp17leQ7M764 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp17leQ7M764 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp17leQ7M764 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp17leQ7M764 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp17leQ7M764 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp17leQ7M764 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp17leQ7M764 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp17leQ7M764 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp17leQ7M764 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp17leQ7M764 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp17leQ7M764 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp17leQ7M764 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp17leQ7M764 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp17leQ7M764 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp17leQ7M764 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp17leQ7M764 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp17leQ7M764 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp17leQ7M764 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp17leQ7M764 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp17leQ7M764 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp17leQ7M764 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp17leQ7M764 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp17leQ7M764 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp17leQ7M764 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp17leQ7M764 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp17leQ7M764 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp17leQ7M764 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp17leQ7M764 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp17leQ7M764 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp17leQ7M764 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp17leQ7M764 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp17leQ7M764 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp17leQ7M764 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp17leQ7M764 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp17leQ7M764 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp17leQ7M764 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp17leQ7M764 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp17leQ7M764 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp17leQ7M764 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 698.1 ms