Protein–RNA interactions for Protein: Q7JJ13

Brd2, Bromodomain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd2Q7JJ13 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brd2Q7JJ13 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Brd2Q7JJ13 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms