Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Eci3Q78JN3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eci3Q78JN3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms