Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms