Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd3eapQ76KJ5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms