Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC8.81□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC8.79□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC8.78□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC8.78□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC8.77□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC8.77□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Syne2Q6ZWQ0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Syne2Q6ZWQ0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms