Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Topbp1Q6ZQF0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Topbp1Q6ZQF0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Topbp1Q6ZQF0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Topbp1Q6ZQF0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Topbp1Q6ZQF0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Topbp1Q6ZQF0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Topbp1Q6ZQF0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Topbp1Q6ZQF0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Topbp1Q6ZQF0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Topbp1Q6ZQF0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Topbp1Q6ZQF0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Topbp1Q6ZQF0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Topbp1Q6ZQF0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Topbp1Q6ZQF0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Topbp1Q6ZQF0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Topbp1Q6ZQF0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Topbp1Q6ZQF0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Topbp1Q6ZQF0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Topbp1Q6ZQF0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Topbp1Q6ZQF0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Topbp1Q6ZQF0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Topbp1Q6ZQF0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Topbp1Q6ZQF0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Topbp1Q6ZQF0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Topbp1Q6ZQF0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Topbp1Q6ZQF0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Topbp1Q6ZQF0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Topbp1Q6ZQF0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Topbp1Q6ZQF0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Topbp1Q6ZQF0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Topbp1Q6ZQF0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Topbp1Q6ZQF0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Topbp1Q6ZQF0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Topbp1Q6ZQF0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Topbp1Q6ZQF0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Topbp1Q6ZQF0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Topbp1Q6ZQF0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Topbp1Q6ZQF0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Topbp1Q6ZQF0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Topbp1Q6ZQF0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Topbp1Q6ZQF0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Topbp1Q6ZQF0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Topbp1Q6ZQF0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Topbp1Q6ZQF0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Topbp1Q6ZQF0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Topbp1Q6ZQF0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Topbp1Q6ZQF0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Topbp1Q6ZQF0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Topbp1Q6ZQF0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Topbp1Q6ZQF0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Topbp1Q6ZQF0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Topbp1Q6ZQF0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Topbp1Q6ZQF0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Topbp1Q6ZQF0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Topbp1Q6ZQF0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Topbp1Q6ZQF0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Topbp1Q6ZQF0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Topbp1Q6ZQF0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Topbp1Q6ZQF0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Topbp1Q6ZQF0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Topbp1Q6ZQF0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Topbp1Q6ZQF0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Topbp1Q6ZQF0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Topbp1Q6ZQF0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Topbp1Q6ZQF0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Topbp1Q6ZQF0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Topbp1Q6ZQF0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Topbp1Q6ZQF0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Topbp1Q6ZQF0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Topbp1Q6ZQF0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Topbp1Q6ZQF0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Topbp1Q6ZQF0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Topbp1Q6ZQF0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Topbp1Q6ZQF0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Topbp1Q6ZQF0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Topbp1Q6ZQF0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Topbp1Q6ZQF0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Topbp1Q6ZQF0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Topbp1Q6ZQF0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Topbp1Q6ZQF0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Topbp1Q6ZQF0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Topbp1Q6ZQF0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Topbp1Q6ZQF0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Topbp1Q6ZQF0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Topbp1Q6ZQF0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Topbp1Q6ZQF0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Topbp1Q6ZQF0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Topbp1Q6ZQF0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Topbp1Q6ZQF0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Topbp1Q6ZQF0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Topbp1Q6ZQF0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Topbp1Q6ZQF0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Topbp1Q6ZQF0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Topbp1Q6ZQF0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Topbp1Q6ZQF0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Topbp1Q6ZQF0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Topbp1Q6ZQF0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Topbp1Q6ZQF0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Topbp1Q6ZQF0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms