Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp34Q6ZQ93 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp34Q6ZQ93 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp34Q6ZQ93 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp34Q6ZQ93 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp34Q6ZQ93 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp34Q6ZQ93 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp34Q6ZQ93 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp34Q6ZQ93 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp34Q6ZQ93 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp34Q6ZQ93 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp34Q6ZQ93 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp34Q6ZQ93 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp34Q6ZQ93 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp34Q6ZQ93 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp34Q6ZQ93 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp34Q6ZQ93 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp34Q6ZQ93 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp34Q6ZQ93 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp34Q6ZQ93 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp34Q6ZQ93 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp34Q6ZQ93 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp34Q6ZQ93 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp34Q6ZQ93 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp34Q6ZQ93 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp34Q6ZQ93 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp34Q6ZQ93 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp34Q6ZQ93 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp34Q6ZQ93 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp34Q6ZQ93 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp34Q6ZQ93 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp34Q6ZQ93 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp34Q6ZQ93 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp34Q6ZQ93 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp34Q6ZQ93 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp34Q6ZQ93 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp34Q6ZQ93 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp34Q6ZQ93 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp34Q6ZQ93 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp34Q6ZQ93 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp34Q6ZQ93 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp34Q6ZQ93 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp34Q6ZQ93 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp34Q6ZQ93 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp34Q6ZQ93 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp34Q6ZQ93 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp34Q6ZQ93 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp34Q6ZQ93 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp34Q6ZQ93 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp34Q6ZQ93 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp34Q6ZQ93 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp34Q6ZQ93 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp34Q6ZQ93 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp34Q6ZQ93 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp34Q6ZQ93 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp34Q6ZQ93 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp34Q6ZQ93 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.3 ms