Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ino80Q6ZPV2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Ino80Q6ZPV2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ino80Q6ZPV2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Ino80Q6ZPV2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ino80Q6ZPV2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ino80Q6ZPV2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ino80Q6ZPV2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ino80Q6ZPV2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ino80Q6ZPV2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ino80Q6ZPV2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ino80Q6ZPV2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ino80Q6ZPV2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Ino80Q6ZPV2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ino80Q6ZPV2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ino80Q6ZPV2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Ino80Q6ZPV2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Ino80Q6ZPV2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ino80Q6ZPV2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ino80Q6ZPV2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ino80Q6ZPV2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ino80Q6ZPV2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ino80Q6ZPV2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ino80Q6ZPV2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ino80Q6ZPV2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ino80Q6ZPV2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ino80Q6ZPV2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ino80Q6ZPV2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ino80Q6ZPV2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ino80Q6ZPV2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ino80Q6ZPV2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ino80Q6ZPV2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ino80Q6ZPV2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ino80Q6ZPV2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ino80Q6ZPV2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ino80Q6ZPV2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ino80Q6ZPV2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ino80Q6ZPV2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ino80Q6ZPV2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ino80Q6ZPV2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ino80Q6ZPV2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Ino80Q6ZPV2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ino80Q6ZPV2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ino80Q6ZPV2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Ino80Q6ZPV2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ino80Q6ZPV2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ino80Q6ZPV2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ino80Q6ZPV2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ino80Q6ZPV2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ino80Q6ZPV2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ino80Q6ZPV2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ino80Q6ZPV2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Ino80Q6ZPV2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ino80Q6ZPV2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ino80Q6ZPV2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ino80Q6ZPV2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ino80Q6ZPV2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ino80Q6ZPV2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ino80Q6ZPV2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ino80Q6ZPV2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ino80Q6ZPV2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ino80Q6ZPV2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ino80Q6ZPV2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Ino80Q6ZPV2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ino80Q6ZPV2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ino80Q6ZPV2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Ino80Q6ZPV2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ino80Q6ZPV2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ino80Q6ZPV2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ino80Q6ZPV2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Ino80Q6ZPV2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ino80Q6ZPV2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ino80Q6ZPV2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ino80Q6ZPV2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ino80Q6ZPV2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ino80Q6ZPV2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ino80Q6ZPV2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ino80Q6ZPV2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ino80Q6ZPV2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ino80Q6ZPV2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ino80Q6ZPV2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ino80Q6ZPV2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ino80Q6ZPV2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Ino80Q6ZPV2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Ino80Q6ZPV2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ino80Q6ZPV2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ino80Q6ZPV2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ino80Q6ZPV2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ino80Q6ZPV2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ino80Q6ZPV2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ino80Q6ZPV2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ino80Q6ZPV2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ino80Q6ZPV2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ino80Q6ZPV2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ino80Q6ZPV2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ino80Q6ZPV2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ino80Q6ZPV2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ino80Q6ZPV2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ino80Q6ZPV2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ino80Q6ZPV2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms