Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7

Opn5, Opsin-5, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn5Q6VZZ7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn5Q6VZZ7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.5 ms