Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ift172Q6VH22 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ift172Q6VH22 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ift172Q6VH22 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ift172Q6VH22 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ift172Q6VH22 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ift172Q6VH22 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ift172Q6VH22 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ift172Q6VH22 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ift172Q6VH22 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Ift172Q6VH22 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ift172Q6VH22 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ift172Q6VH22 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms