Protein–RNA interactions for Protein: Q6UJY2

Slc9c1, Sodium/hydrogen exchanger 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9c1Q6UJY2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc9c1Q6UJY2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc9c1Q6UJY2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Slc9c1Q6UJY2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc9c1Q6UJY2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc9c1Q6UJY2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc9c1Q6UJY2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc9c1Q6UJY2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc9c1Q6UJY2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc9c1Q6UJY2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc9c1Q6UJY2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc9c1Q6UJY2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc9c1Q6UJY2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc9c1Q6UJY2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc9c1Q6UJY2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc9c1Q6UJY2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc9c1Q6UJY2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc9c1Q6UJY2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc9c1Q6UJY2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc9c1Q6UJY2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms