Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ7

Cd300lf, CMRF35-like molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lfQ6SJQ7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cd300lfQ6SJQ7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cd300lfQ6SJQ7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cd300lfQ6SJQ7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Cd300lfQ6SJQ7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cd300lfQ6SJQ7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cd300lfQ6SJQ7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cd300lfQ6SJQ7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cd300lfQ6SJQ7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cd300lfQ6SJQ7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cd300lfQ6SJQ7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Cd300lfQ6SJQ7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cd300lfQ6SJQ7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cd300lfQ6SJQ7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cd300lfQ6SJQ7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cd300lfQ6SJQ7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cd300lfQ6SJQ7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cd300lfQ6SJQ7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cd300lfQ6SJQ7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cd300lfQ6SJQ7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cd300lfQ6SJQ7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cd300lfQ6SJQ7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Cd300lfQ6SJQ7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cd300lfQ6SJQ7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cd300lfQ6SJQ7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cd300lfQ6SJQ7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cd300lfQ6SJQ7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cd300lfQ6SJQ7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cd300lfQ6SJQ7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cd300lfQ6SJQ7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cd300lfQ6SJQ7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cd300lfQ6SJQ7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cd300lfQ6SJQ7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd300lfQ6SJQ7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms