Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L9

Shc4, SHC-transforming protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc4Q6S5L9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shc4Q6S5L9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Shc4Q6S5L9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms