Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc154Q6RUT8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc154Q6RUT8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc154Q6RUT8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc154Q6RUT8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc154Q6RUT8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc154Q6RUT8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc154Q6RUT8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc154Q6RUT8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc154Q6RUT8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc154Q6RUT8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc154Q6RUT8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc154Q6RUT8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc154Q6RUT8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc154Q6RUT8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc154Q6RUT8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc154Q6RUT8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc154Q6RUT8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc154Q6RUT8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc154Q6RUT8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc154Q6RUT8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc154Q6RUT8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc154Q6RUT8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc154Q6RUT8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc154Q6RUT8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc154Q6RUT8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc154Q6RUT8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc154Q6RUT8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc154Q6RUT8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc154Q6RUT8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc154Q6RUT8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc154Q6RUT8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc154Q6RUT8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc154Q6RUT8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc154Q6RUT8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc154Q6RUT8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc154Q6RUT8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc154Q6RUT8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc154Q6RUT8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc154Q6RUT8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc154Q6RUT8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc154Q6RUT8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc154Q6RUT8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc154Q6RUT8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc154Q6RUT8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc154Q6RUT8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc154Q6RUT8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc154Q6RUT8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc154Q6RUT8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc154Q6RUT8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc154Q6RUT8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc154Q6RUT8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc154Q6RUT8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc154Q6RUT8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc154Q6RUT8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc154Q6RUT8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc154Q6RUT8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc154Q6RUT8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc154Q6RUT8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc154Q6RUT8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc154Q6RUT8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc154Q6RUT8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc154Q6RUT8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc154Q6RUT8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc154Q6RUT8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc154Q6RUT8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc154Q6RUT8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc154Q6RUT8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc154Q6RUT8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms