Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT7

Ccsmst1, Protein CCSMST1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccsmst1Q6RUT7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccsmst1Q6RUT7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccsmst1Q6RUT7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccsmst1Q6RUT7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccsmst1Q6RUT7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccsmst1Q6RUT7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccsmst1Q6RUT7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccsmst1Q6RUT7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccsmst1Q6RUT7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccsmst1Q6RUT7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccsmst1Q6RUT7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccsmst1Q6RUT7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccsmst1Q6RUT7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccsmst1Q6RUT7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccsmst1Q6RUT7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccsmst1Q6RUT7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccsmst1Q6RUT7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccsmst1Q6RUT7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccsmst1Q6RUT7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccsmst1Q6RUT7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccsmst1Q6RUT7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccsmst1Q6RUT7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccsmst1Q6RUT7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccsmst1Q6RUT7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccsmst1Q6RUT7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccsmst1Q6RUT7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccsmst1Q6RUT7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccsmst1Q6RUT7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccsmst1Q6RUT7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccsmst1Q6RUT7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccsmst1Q6RUT7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms