Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Bnip1Q6QD59 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms