Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc82Q6PG04 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc82Q6PG04 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc82Q6PG04 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc82Q6PG04 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc82Q6PG04 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc82Q6PG04 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc82Q6PG04 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc82Q6PG04 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc82Q6PG04 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc82Q6PG04 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc82Q6PG04 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc82Q6PG04 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc82Q6PG04 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc82Q6PG04 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc82Q6PG04 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc82Q6PG04 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc82Q6PG04 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc82Q6PG04 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc82Q6PG04 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc82Q6PG04 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc82Q6PG04 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc82Q6PG04 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc82Q6PG04 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc82Q6PG04 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc82Q6PG04 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc82Q6PG04 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc82Q6PG04 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc82Q6PG04 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc82Q6PG04 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc82Q6PG04 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc82Q6PG04 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc82Q6PG04 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc82Q6PG04 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc82Q6PG04 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc82Q6PG04 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc82Q6PG04 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc82Q6PG04 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc82Q6PG04 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc82Q6PG04 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc82Q6PG04 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc82Q6PG04 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc82Q6PG04 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc82Q6PG04 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc82Q6PG04 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc82Q6PG04 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc82Q6PG04 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc82Q6PG04 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc82Q6PG04 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc82Q6PG04 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc82Q6PG04 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms