Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gramd2bQ6PEM6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gramd2bQ6PEM6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gramd2bQ6PEM6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms