Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDG5

Smarcc2, SWI/SNF complex subunit SMARCC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc2Q6PDG5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarcc2Q6PDG5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarcc2Q6PDG5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms