Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SvoplQ6PDF3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.3 ms