Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC8

Mfsd4a, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4aQ6PDC8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mfsd4aQ6PDC8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms