Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RgmaQ6PCX7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RgmaQ6PCX7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms