Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAJ1

Bcr, Breakpoint cluster region protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcrQ6PAJ1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BcrQ6PAJ1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BcrQ6PAJ1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BcrQ6PAJ1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BcrQ6PAJ1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BcrQ6PAJ1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BcrQ6PAJ1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BcrQ6PAJ1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BcrQ6PAJ1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BcrQ6PAJ1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BcrQ6PAJ1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BcrQ6PAJ1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BcrQ6PAJ1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BcrQ6PAJ1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BcrQ6PAJ1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BcrQ6PAJ1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BcrQ6PAJ1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BcrQ6PAJ1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BcrQ6PAJ1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BcrQ6PAJ1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BcrQ6PAJ1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BcrQ6PAJ1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BcrQ6PAJ1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BcrQ6PAJ1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BcrQ6PAJ1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BcrQ6PAJ1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BcrQ6PAJ1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BcrQ6PAJ1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BcrQ6PAJ1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BcrQ6PAJ1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BcrQ6PAJ1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BcrQ6PAJ1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BcrQ6PAJ1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.7 ms