Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp49Q6P9L4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp49Q6P9L4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp49Q6P9L4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp49Q6P9L4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp49Q6P9L4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp49Q6P9L4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp49Q6P9L4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp49Q6P9L4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp49Q6P9L4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp49Q6P9L4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp49Q6P9L4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp49Q6P9L4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp49Q6P9L4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp49Q6P9L4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp49Q6P9L4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp49Q6P9L4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp49Q6P9L4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp49Q6P9L4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp49Q6P9L4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp49Q6P9L4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp49Q6P9L4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp49Q6P9L4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp49Q6P9L4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp49Q6P9L4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp49Q6P9L4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp49Q6P9L4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp49Q6P9L4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp49Q6P9L4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp49Q6P9L4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp49Q6P9L4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp49Q6P9L4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp49Q6P9L4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp49Q6P9L4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp49Q6P9L4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp49Q6P9L4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp49Q6P9L4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp49Q6P9L4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp49Q6P9L4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Usp49Q6P9L4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Usp49Q6P9L4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp49Q6P9L4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp49Q6P9L4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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