Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8X1

Snx6, Sorting nexin-6, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx6Q6P8X1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx6Q6P8X1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx6Q6P8X1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx6Q6P8X1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx6Q6P8X1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx6Q6P8X1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx6Q6P8X1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx6Q6P8X1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx6Q6P8X1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx6Q6P8X1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx6Q6P8X1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx6Q6P8X1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx6Q6P8X1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx6Q6P8X1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx6Q6P8X1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx6Q6P8X1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx6Q6P8X1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx6Q6P8X1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx6Q6P8X1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx6Q6P8X1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx6Q6P8X1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx6Q6P8X1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx6Q6P8X1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx6Q6P8X1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx6Q6P8X1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx6Q6P8X1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx6Q6P8X1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx6Q6P8X1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx6Q6P8X1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx6Q6P8X1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx6Q6P8X1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx6Q6P8X1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx6Q6P8X1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx6Q6P8X1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx6Q6P8X1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx6Q6P8X1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx6Q6P8X1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx6Q6P8X1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx6Q6P8X1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx6Q6P8X1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx6Q6P8X1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx6Q6P8X1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx6Q6P8X1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms