Protein–RNA interactions for Protein: Q6P539

Fam222b, Protein FAM222B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam222bQ6P539 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam222bQ6P539 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam222bQ6P539 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam222bQ6P539 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam222bQ6P539 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam222bQ6P539 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam222bQ6P539 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam222bQ6P539 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam222bQ6P539 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam222bQ6P539 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam222bQ6P539 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam222bQ6P539 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam222bQ6P539 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam222bQ6P539 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam222bQ6P539 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam222bQ6P539 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam222bQ6P539 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam222bQ6P539 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam222bQ6P539 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam222bQ6P539 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms