Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg2aQ6P4T0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg2aQ6P4T0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg2aQ6P4T0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg2aQ6P4T0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg2aQ6P4T0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg2aQ6P4T0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg2aQ6P4T0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg2aQ6P4T0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg2aQ6P4T0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg2aQ6P4T0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg2aQ6P4T0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg2aQ6P4T0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg2aQ6P4T0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg2aQ6P4T0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg2aQ6P4T0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg2aQ6P4T0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg2aQ6P4T0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg2aQ6P4T0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg2aQ6P4T0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg2aQ6P4T0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg2aQ6P4T0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms